Análisis in silico del agonismo de ácidos hidroxicinámicos al Receptor Gamma Activado por Proliferador de Peroxisomas

Resumen

La activación dependiente de ligandos del Receptor Gamma Activado por Proliferador de Peroxisomas (PPARγ) puede revertir un tejido fibrótico a su estado sano. El objetivo del presente trabajo fue analizar con métodos computacionales (in silico) el potencial agonismo del ácido cafeico, ferúlico y sinapínico de esta diana terapéutica. Se realizó el acoplamiento molecular con el sitio de unión de ligandos (LBD, por sus siglas en inglés) de la proteína, en el que se revelaron los aminoácidos con los cuales interactúan los ácidos antes mencionados y sus energías de interacción. El análisis mostró que el ácido cafeico interactúa con la hélice alfa 12 (H12), dentro de unos rangos de energía de -5.3 a -6.3 kcal/mol, el ácido ferúlico con la hélice alfa 3 (H3) dentro de unos rangos de energía entre -5.5 y -6.3 kcal/mol, el ácido sinapínico con la hélice alfa 3 (H3) dentro de un rango de energía de -5.6 a -5.7 kcal/mol, que corresponden al sitio de unión de ligandos (LBD) de activación parcial de la proteína. Basado en estos resultados, el ácido sinapínico resultó ser el mejor candidato para ser evaluado como agonista selectivo para una activación parcial, algo que se busca en el diseño de fármacos, ya que una activación total de esta proteína conlleva efectos secundarios fisiológicos como osteoporosis, acumulación de lípidos en exceso, cáncer, entre otros.